В последнее десятилетие в Эстонии ускорилась вырубка лесов, что означает, что значительная часть углерода, накапливавшегося в наших лесах в течение десятилетий, выделяется в атмосферу одновременно. С климатической точки зрения, вырубка более 8,4 миллиона кубометров в год оказывает негативное влияние, так как в этом случае в атмосферу выделяется больше углерода, чем одновременно поглощает лес в ходе разрастания. Понадобится около полувека, чтобы новый растущий лес начал опять поглощать углерод в том же объёме.

Помимо общих проблем, связанных с интенсивной вырубкой лесов, в случае с Эстонией специфично то, что здесь около 30% лесов располагаются на осушенных площадях, т. е. на торфяниках, и на этих площадях вырубка лесов по принципу сплошной рубки особенно враждебна климату.

Хотя в сжигании древесины видят возможность для увеличения доли возобновляемой энергии в производстве электроэнергии и тепла, это не является безусловно благоприятным для климата подходом. Если это происходит в неэффективных котельных, таких как сланцевые электростанции, то это означает бессмысленное расходование и так ограниченных лесных ресурсов. Если для производства возобновляемой энергии мы должны вырубать больше леса, то от этого больше вреда для климата, чем пользы.